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知几未来参与拟定微生物测序与分析专家共识推动建立国家级评估标准及相关法规、指南

日期:2019-06-10 06:09

  2019年6月1日,第一届关于《微生物测序与分析专家共识》的微生物组学与技术研讨会在北京中科院微生物研究所落下帷幕。

  本次会议由中国生物工程学会、微生物组学与技术专业委员会、中国科学院微★▽…◇生物研究所联合主办。中国科学院院士、中国疾控中心主任、中国生物工程学会理事长高福院士作为名誉主席,中国科学院微生物研究所研究员、中国生物工程学会微生物组学与技术专业委员会主任朱宝利担任主席。中国生物工程学会微生物◆▼组学与技术专委会常委段云峰主持了此次会议。

  与会人员还有,军事医学科学院微生物流行病研究所杨瑞馥研究员、国家人类基因组南方研究中心王升跃教授、中国食品药品检定研究院食品化妆品检验检测中心崔生辉教授、中国食品药品检定研究院曾明研究员,以及来自illumina、赛默飞、Pacific Biosciences、深圳华大智造等业内知名企业的40多个科学家和技术人员代表。

  知几未来生命科技集团作为企业代表及支持单位受邀出席会议,知几未来生信科学家江月博士受邀发表主题演讲,与诸多同仁、专家一起,推动建立微生物组测序与分析共识。

  这是首个探讨微生物组测序与分析专家共识的会议。重点围绕微生物组测序与分析技术,包括微生物组学相关的样本采集、保存和测序技术、数据分析和生物信息学分析技术的应用,由这次研讨会为开端,初步形成专家共识,从而指导中国的微生物组科研和临床研究与应用。

  “微生物组的测序和分析,现在还没有统一的标准”,朱宝利研究员在开场致辞中表示,“我们希望行业中的测序专家在一起,共同拟定专家共识,为国家层面◇•■★▼的标准制定提供参考”。

  在我国,微生物组学研究于2017年被列入了我国“十三五”重点研发计划,相继启动了“人体与环境健康的微生物组共性技术研究”、“中科院微生物组计划”等多个重要项目,科学研究成果的不断涌现,国内相关的创业公司也如雨后春笋。

  近年来,人体微生物领域相▷•●关研究成果颇丰,也为人类对疾病的认知打开了另一◇=△▲扇大门。自2004年以来,在《Science》《Nature》《Cell》等顶级学术刊物上发表的有关肠道菌群与疾病和健康关系的研究论文已经有上百篇,其他各类生物医学刊物的相关论文已有上千篇。肠道微生物影响了人体70%的免疫力、排除了80%的毒素以及消化吸收了95%的★△◁◁▽▼营养物质;人体微生态,尤其肠道微生态失衡已被证实与包括肿瘤、免疫系统疾病、代谢系统疾病在内的50多种重大和慢性疾病直接或间接相关。

  纵观行业现状,尽管微生物组学相关的产业链及商业化产品也呈现出了长尾化及多元性,如to B的科研检测、to C的健康管理产品,甚至是下游微生物制剂产品;但整个行业却◆●△▼●缺乏可供参考的行业标准。

  和基▪▲□◁于人体的基因测序技术所不同的是,基于微生物组的基因测序技术是一个多次伴随检测的过程。在相关标准尚未建立的情况下,无论是偏向临床应用的医学产品;还是偏向大健康的管理类产品,都存在未知和风险。

  “共识的建立对行业是一件好事。我们希望联合各个测序公司宣传相关技术,相当于一起做基础的测序科普(包括试剂的使用)。这些知识可能是现在一些临床医生、科研人员也未必清楚的“,朱宝利研究员说,“我们的整体思路是,一为临床工作提供数据,二为国家提供参考“。

  研讨会上,知几未来生物信息科学家江月博士,首先为大家介绍和比较了国际现有的两个微生物组标准,包括微生物组质控基线项目(MBQC)及国际人类微生物组标准(IHMS)两个项目。

  微生物组质控基线年启动。采用的方法是将不同样本分给不同实验室盲测,然后比较相同样本的生信分析结果。该项目提出:实验方法的影响大于生信分析,但不同的生信分析对同一结果的挖掘也是存在差异的;该项目共提供了15个实验室方案和9个生信分析方案,形成了DNA的提取标准。

  国际人类微生物组标准(IHMS)由12个国家(跨国)23个组织完成,其中包括复旦大学和华大。其目的在于建立一个操作流程的标准,以提高数据结果的质量和兼容性。该项目最终推荐了一个最佳流程,并提出相对定量标准优于绝对定量标准。

  然后,在结合两个☆△◆▲■项目的实验方案及研究结果的基础上,江月博士建议:在形成国内微生物测序标准时,综合多目的、多场景的需求,采用多流程、多方案的标准,以全面涵盖实际应●用中可能遇到的挑战和场景的建议。

  以知几未来为例。知几未来着力形成以患者为中心的临床研究模式,主要是针对临床提供微生物检测服务;知几未来成都临床医学检验中心,是西南地区最大的实验基地之一,积累了大量发明专利和软▲=○▼件著作权,自有测序技术和生信分析平台,已经成◆■功应用于临床,显著提高了检测的速度和精度。对此,江月博士在会上也提出,对于消费级产品和应用于临床、科研的微生◁☆●•○△物组学相关产品,其标准是否应当根据不同应用场景加以区分或结合。

  同时,针对标准流程中关键环节的标准制定,江月博士也提出了两套解决方案,一是可以借鉴IHMS项目中“应用模拟菌落的样本进行多机构盲测”的方案来进行相关关键点分析;二是直接对比单环节中各家标准,择优选用。

  尽管微生物组测序的监管机制建立还需要时间,但只有在监管制度建立起来后,微生物组学的相关产品和市场才能更好更快地服务于民众,为国★-●=•▽家相关职能部门提供可参考的技术依据,促进微生物组相关的产业的良性发展,保障规模型和规范的企业利益,加强行业自律,避免不规范的企业扰乱市场,对行业造成不良影响。

  一直以来,知几未来都致力于通过人体微生态服务,改善国民,尤其是母婴群体的身体健康素质,为民众提供优质的全链条多元化和个性化的人体微生态服务。此次,知几未来能够受邀参加微生物组学与技术研讨△▪▲□△会,参与到《微生物测序与分析专家共识》的制定中,也与此密不可分。

  未来,知几未来将继续响应国家“十•□▼◁▼三五”计划的号召,深刻贯彻习总书记提出的“大健康理念”,以助力微生物组测序国家级评估标准及相关法规★◇▽▼•与指南的建立落实为己任,共建微生物组学教育专业交流平台,提供精准科学的微生物组学相关科普知识,为构建更现代化的医疗体系与高质量的医学教育体系作出实质贡献。

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